膜萃取主要為大體積水樣而設計的，膜萃取速度快是其優點，而且不容易堵塞，但是單個樣品的處理成本較柱萃取高。膜萃取主要代表Horizon公司的SPE-DEX 4790。美國Gilson公司的GX-274 ASPE，日本GL Sciences公司的AQUA Trace ASPE799也都使用柱萃取。而美國DIONEX的AutoTrace 280 和MC的MULTI-SPE A208可以同時兼容柱式和盤式萃取，也可以進行雙柱串聯萃取。
