產甲烷菌是專性厭氧菌，它分離和培養等的操作均需要在特殊環境和用特殊的技術進行。
培養方法分類：一般要求不高的可用在液面加石蠟或液體石蠟的液體深層培養法、抽真空的培養法、在封閉培養管中放入焦性沒食子酸和碳酸鉀除去氧的培養方法（Berker）、Hungate的厭氧滾管法、Hungate的厭氧液體培養法、Balch的厭氧液體培養增壓法等。
具體方法介紹：最好的是厭氧手套箱，它由四部分組成：
1、附有手套的密閉透明薄膜箱
2、附有兩個可開啟的可抽真空的金屬空氣隔離箱
3、真空泵
4、氫和高純氮的供應系統
利用厭氧手套箱可做許多工作，如：分裝厭氧培養基，倒制平板，離心厭氧微生物收集菌體，對氧敏感的酶和輔酶的分離純化，進行電泳、厭氧性生物化學反應和遺傳學研究等。