1、診斷：
根據臨床表現，結合超聲心動圖和血培養結果，多能做出診斷。傳染性心內膜炎，主要為敗血癥的臨床表現，尤其在心臟無雜音時，本病常為原發感染所掩蓋，易于漏診，對一周以上的發熱，需注意心臟聽診改變，皮膚出血點及栓塞現象。常需與流行性感冒、急性關節炎、急性化膿性腦膜炎、急性腎盂腎炎等鑒別。近年來，由于心臟外科學手術的進展和抗生素的廣泛應用，不典型或特殊類型的感染性心內膜炎有日漸增加之勢，如人工瓣膜置換術，血液透析或先心病矯正術后，均增加了心內膜感染機會，對手術后發熱患者，應提高警惕。
2、鑒別診斷：
傳染性心內膜炎主要須與活動期風濕性心臟病以及金黃色葡萄球菌革蘭陰性桿菌所引起的敗血癥相鑒別。當以并發癥栓塞為突出表現時，應與腦血管意外、急性腎小球腎炎、脈管炎、冠心病或心絞痛等疾病進行鑒別。