膽固醇在大腦、脊髓、神經系統和肌肉中廣泛存在。膽固醇在人體內的分布極不均勻，腦和神經組織中含量較高，其次為腎、脾、皮膚和肝。腺體組織的膽固醇含量一般比骨骼肌高。全身膽固醇總量（約140克）的1/4存在于腦和神經組織內，其中20%在大腦，33%在神經系統，25%在肌肉，余下的分布在內臟器官的血液中。每100克組織中約含膽固醇2克（2%）；腎、脾、皮膚和肝、小腸黏膜等內臟，以及脂肪組織中膽固醇含量也比較高，達0.2%~0.5%；肌肉組織中膽固醇含量較少，占0.1%~0.2%；骨質中含量最少，僅占0.01%。