低磷性骨軟化癥主要與遺傳有關。包括X連鎖低磷性佝僂病(XLH),常染色體顯性遺傳低磷性佝僂病(ADHR),遺傳性低磷性佝僂病合并高尿鈣癥(HHRH),X連鎖隱性低磷性佝僂病(XRHR)。此外還有獲得性的原因,如腫瘤性骨軟化癥(TIO)。