1.類白血病反應
兒童類白血病反應的特點是：存在明確的導致類白血病反應的基礎疾病，如感染、結核病等；脾臟及各臟器無白血病細胞浸潤；白細胞堿性磷酸酶活性增高或正常；血小板計數不降低；粒細胞可見中毒顆粒及空泡；基礎疾病控制后血象則回復正常。
2.幼年型粒單核細胞白血病（JuvenileMyelomonocyticLeukemia，JMML）
WHO將JMML分類為骨髓增生異常/骨髓增值性疾病（腫瘤）（MDS/MPN），屬髓系腫瘤。本病發生于4歲以下幼兒或嬰兒，約占兒童白血病的1.5%，20%患兒有RAS基因突變。
診斷標準為：
（1）外周血單核細胞增多>1X10/L；
（2）原始細胞（包括原、幼單核細胞）少于外周血白細胞或骨髓有核細胞的20%；
（3）Ph陰性，BCR/ABL陰性；
（4）外加下列三項中的任何兩項：①胎兒血紅蛋白（HbF）高于年齡應有值，②外周血（PB）中有不成熟細胞，③WBC>10X10/L，克隆性染色體異常（常為7單體）；
（5）粒單系祖細胞在體外培養中對GM-CSF高度敏感。由于JMML與幼年型CML在發病情況、臨床表現、實驗室檢查和預后等方面均頗為相似，因此，JMML和幼年型CML是否為同一種疾病擬或是不同疾病的相似表現，在學界存在有不同的觀點。有學者認為，JMML與成人亞急性或慢性粒單核細胞白血病有更多的相似之處。
3.家族性骨髓增生性疾患
本病在臨床及化驗方面甚似CML，可有白細胞增高、肝脾明顯腫大、貧血、血小板減少等。但本病有家族史，肝脾活檢表現為髓外造血而無白血病細胞浸潤，Ph染色體陰性，胎兒血紅蛋白正常；抗白血病治療無效，脾切除有時可糾正脾功能亢進，有些病例可自行緩解。