（一）管理傳染源 及早發現患者并進行隔離，隔離期自發病起40天或出現痙咳后30天。密切接觸者應隔離檢疫2～3周。
（二）切斷傳播途徑 室內通風換氣，每日用紫外線消毒病房。
（三）保護易感者
1、主動免疫 國內目前常用百白破（百日咳、白喉、破傷風）三聯疫苗。自出生3～6個月開始預防接種。劑量為0.5、0.5、0.5ml，每隔4～6周皮下注射一次。有過敏史、驚厥史、患急性病者禁用百日咳菌苗。
2、被動免疫 肌注高效價免疫球蛋白1.25ml，隔日1次，連用3～5次，可減輕癥狀。
3、藥物預防 對無免疫力而又有百日咳接觸史的患兒可用紅霉素、復方新諾明進行預防，連續用藥7～10天。