母親血清或羊水中甲胎蛋白含量增高，胎兒血液染色體核型變異，提示胎兒可能存在腸道畸形。
1.X線腹部平片
X線腹部平片對診斷腸閉鎖和腸狹窄有很大價值。高位空腸閉鎖腹部直立位平片顯示“三氣泡征”；或上腹部一個胃的大液平和3～4個擴張的空腸小液平；下腹部無氣體影。小腸低位閉鎖則顯示較多的擴張腸袢，且有多數液平面。除最遠的腸袢極度擴張外，其他擴張腸袢的口徑大多均勻一致，側位片上結腸及直腸內無氣體，此點與麻痹性腸梗阻不同。
對腸閉鎖患兒進行鋇餐檢查是不適宜的，因有引起吸入性肺炎的危險。然而對臨床上不典型的病例進行鋇灌腸檢查是有必要的，不但可以確定胎兒腸閉鎖的診斷，確定結腸有無閉鎖，而且還可以除外先天性巨結腸或腸旋轉不良。腸狹窄的病例常須行鋇餐檢查使診斷明確。在透視下可見鋇劑堆積在阻塞部位，僅有少量鋇劑通過狹窄段進入遠端腸腔。
2.產前B超檢查
產前作B型超聲掃描對診斷胎兒小腸閉鎖很有價值。高位空腸閉鎖顯示從胃延伸至空腸近端有一長形液性區，或在胎兒腹腔上部探測出數個擴張的空腸液性區。