（1）人血丙種球蛋白
抗體缺乏患者人血丙種球蛋白替代治療是必要的。抗生素和靜脈注射免疫球蛋白（IVIG）聯合應用是被推薦的標準治療。在先天性X-聯無丙種球蛋白血癥和低丙種球蛋白血癥患者預防性IVIG可以顯著降低感染發生率。應用巨細胞病毒（CMV）高免疫性IVIG在器官移植患者能減少CMV肺炎。治療用IgG劑量400mg/kg。作為替代治療或預防性使用可根據血清IgG水平計算，據估計每月IVIG100mg/kg可以提高血清IgG濃度200mg/d1。由于靜脈用制劑生產技術的改進，IVIG不需要配型，使肝炎病毒、TIV和CMV等感染危險性極小，目前主張靜脈治療，可以避免肌內注射的許多不良反應，而且可以在家庭使用，從而節約費用。
（2）血漿
在各種選擇性免疫球蛋白缺乏和補體缺乏患者因為尚缺少各種相應成分的精純制劑，故可用血漿作為補充治療。
（3）轉移因子和胸腺素 前者為人白細胞溶解產物提取的一種非免疫原性、低分子量（<10000）蛋白質，可以用于Wiskott-Aldrieh綜合征和慢性黏膜念珠菌病，但據報道療效差異很大，而且有腎毒性，有時會出現溶血性貧血等并發癥。后者為牛胸腺組織部分純化的提取物，用于共濟失調毛細血管擴張綜合征、Wiskott-Aldrich綜合征、DiGeorge綜合征和Nezeloff綜合征能獲得一定的臨床改善，但可引起過敏反應，亦有發生肝炎的報告。總的來說轉移因子和胸腺素應用尚待積累經驗，目前尚無普遍接受的I期臨床應用方案，仍限于研究用。
（4）骨髓、胎兒、胸腺和胎兒肝臟移植
成功用于重度聯合免疫缺陷，Wiskott-Aldrich綜合征等。遠期療效尚待觀察。
（5）其他
腺苷脫氨酶和核苷磷酸化酶可應用于代謝缺陷患者，高劑量維生素C可用于高IgE癥和白細胞趨化異常者。最近報道，γ-干擾素用于慢性肉芽腫病患者取得良效，正在進一步試驗中。基因治療遺傳性或先天性免疫缺陷是最有前途的治療方法，但可能由于此類疾病總體上病例數較少，目前研究進展不大。