腹腔動脈、腸系膜上動脈和腸系膜下動脈是胃腸道的營養血管。它們之間的側支循環可提供足以維持受累腸管活力和功能的血供。因此，大多數單獨的腸系膜上動脈慢性閉塞是無癥狀的。然而，當有第2支血管也有供血不足時，則相對缺血的腸管不能滿足攝食所需的血供增加要求這是腸絞痛典型的“進食痛”的原因。
而導致內臟動脈逐漸閉塞主要原因是的粥樣硬化癥。動脈造影和尸檢發現，老齡人群中動脈硬化性閉塞引起慢性腸系膜缺血的發病率呈上升趨勢。高血壓和吸煙為動脈硬化性閉塞癥的主要危險因素。
較少見的病變還有腹腔神經節壓迫腹腔動脈膨脹的主動脈假性動脈瘤或分離性動脈瘤、血栓閉塞性脈管炎或結節性動脈周圍炎累及腹腔動脈等。有一種罕見的內側弓形韌帶綜合征(medial arcuate ligament syndrome)，是由于腹腔動脈起點位置高，或腹腔動脈起點正常但該韌帶位置低從而壓迫腹腔動脈使其部分閉塞所致。