酵母菌
酵母菌的代謝作用如同許多微生物一樣包含有能的增加或積聚（異化作用）和能量的消耗或生物合成途徑(同化作用),這些過程包括簡單的原子、原子團或電子的轉移。生長就是這些氧化還原作用反應平衡的作用，以異化作用釋放出的部分能量，可用來促使蛋白質及細胞所需要的其他物質的合成。酵母菌在生產中的應用十分廣泛，除了熟知的釀酒、發面外，還能用于生產有機酸、提取多種酶等。
甲基營養菌
甲基營養菌代謝甲醛的異化途徑，是通過輔酶因子自發地或者在酶的催化作用下使甲醛與C1載體結合并將其氧化為中間產物甲酸，甲酸在甲酸脫氫酶的作用下氧化為CO2。甲基營養菌代謝甲醛的異化途徑包括四氫葉酸途徑（THF）、四氫甲烷蝶呤途徑（H4MPT）、谷胱甘肽 （GSH/MySH）途徑，涉及到關鍵酶及其編碼基因。深入研究甲醛異化途徑、關鍵酶、基因及其功能，是構建凈化甲醛工程菌和開發凈化甲醛轉基因植物的關鍵。