托幼機構出現單純皰疹患者后，應囑其在家隔離，治療痊愈后始能返回。患生殖器皰疹的孕婦應采用剖宮產分娩。近期曾有生殖器皰疹病史的孕婦應抽取羊水標本檢測IgM型HSV抗體，陽性者即提示胎兒已罹患宮內感染，可與患者夫婦討論是否考慮選擇0.1%滴眼液滴眼，并與患母隔離，避免由患母哺育，直至患母痊愈；待產期及產后在院觀察期間，患母及其新生兒均應與其他產婦及新生兒隔離。
堅持婚前體檢制度，避免多性伴性行為，提倡安全的性生活；必要的情況下，性交時使用安全套，有助于控制或減少生殖器皰疹的感染流行。器官移植（包括骨髓移植）術后立即使用阿昔洛韋。對皰疹頻繁復發的患者，應盡量去除或避免誘發因素。以上措施均有助于預防單純皰疹感染的發生或原有隱伏性感染的發作。預防單純皰疹的疫苗已進入臨床試驗階段。