1、該品有引起耳毒性和腎毒性的可能，故不宜用于長程治療（如結核病），通常療程不超過14天。
2、下列情況應慎用該品：失水、第8對腦神經損害、重癥肌無力或帕金森病、腎功能損害患者。
3、對一種氨基糖苷類抗生素，如鏈霉素、慶大霉素或阿米卡星等過敏的患者，可能對該品也過敏。
4、在用藥過程中應注意進行下列檢查：（1)尿常規檢查和腎功能測定，以防止出現嚴重腎毒性反應。（2)聽力檢查或聽電圖尤其高頻聽力測定，對老年人更為重要。
5、有條件時應監測血藥濃度，尤其新生兒、老年人和腎功能減退的患者。每12小時給藥1次時，血藥峰濃度宜保持在15～30mg/ml，谷濃度5～10mg/ml；每24小時用藥1次時血藥峰濃度宜保持在56～64mg/ml，谷濃度<1mg/ml。
6、對診斷的干擾：可使丙氨酸氨基轉移酶(ALT)、門冬氨酸氨基轉移酶（AST)、血清膽紅素濃度及血清乳酸脫氫酶濃度的測定值增高；血鈣、鎂、鉀、鈉濃度的測定值可能降低。該品屬氨基糖苷類，在兒科中應慎用，尤其早產兒及新生兒中不宜應用，因其腎臟組織尚未發育完全，使本類藥物的半衰期延長，可能在體內積蓄而產生毒性反應。在孕婦用藥中該品屬D類，即對人類有危害，但用藥后可能利大于弊。卡那霉素B可穿過胎盤屏障進入胎兒組織，有引起胎兒聽力損害的可能。妊娠婦女使用該品前必須充分權衡利弊。該品在乳汁中分泌量很低，但通常哺乳期婦女在用藥期仍宜暫停哺乳。老年患者應用該品后容易引起各種毒性反應，因此有條件時應在療程中監測血藥濃度，此外老年患者的腎功能有一定程度生理性減退，即使其腎功能測定值在正常范圍內仍應采用較小治療量。