成人原發型肺結核治療方案基本與肺結核短程化療方案相同。兒童、青少年原發型肺結核多見，其治療基本原則也與成人一致，但鹽酸乙胺丁醇可引起視覺損害難以監測，故一般幼兒（<8歲）較少應用。
內科治療
1.全身治療
結核病是慢性、全身性疾病，合理的營養（選用富含蛋白質和維生素的食物），適當的休息仍然是治療的基礎。
2.抗結核化學治療
抗結核化學治療是結核病最主要的治療方法。化療原則為早期、規律、全程、適量、聯合五項原則。整個化療方案分為強化和鞏固兩個階段。多數患者不住院治療, 采用醫務人員直接督導下化療，同樣收到良好效果。
3.抗結核化學治療方案
常用抗結核病治療方案為2HRZ S(E)/4HR方案：強化期2個月，異煙肼（H）、利福平（R）、吡嗪酰胺（Z）及鏈霉素（S）或乙胺丁醇（E）4種藥；鞏固期4個月，異煙肼（H）、利福平（R）2種藥，總療程為6個月。以下情況應延長鞏固期，使總療程為9月～12月，如：強化期不含吡嗪酰胺（Z）的方案，胸內淋巴結較大或斷層及CT證實有多組淋巴結腫大，懷疑有原發耐藥（如原發耐藥較高地區，此時鞏固期可加用乙胺丁醇），合并肺外結核或有機體免疫功能損害等患者。
外科治療
1.淋巴結支氣管瘺，化療無效經久不愈者，可行瘺孔修補術；
2.胸內淋巴結結核。干酪樣液化壞死，化療無效，可作胸內淋巴結摘除術。
3.腫大淋巴結引起肺不張伴不可逆的支氣管擴張，或反復咯血及繼發感染者。