變異鏈球菌是早在1924年Clarke已經報告過變異鏈球菌是齲齒的病原菌。這種菌在普通培養基中呈球形，而在葡萄糖培養基中菌體變長，所以叫作變異鏈球菌。但當時普遍認為嗜酸桿菌等是齲齒最主要的病原菌，而變異鏈球菌并未得到重視。乃至40年后才又重新發現變異鏈球菌是引起齲齒最主要的細菌。變異鏈球菌與齲齒的關系主要是：
①能在牙面上形成水不溶性的多糖類，牢固地黏著在牙面上；
②在同樣pH條件下，變異鏈球菌比血鏈球菌和乳酸桿菌等能溶出更多的鈣；
③變異鏈球菌能使蔗糖變為葡聚糖，并使葡萄糖幾乎全部變為乳酸。變異鏈球菌是齲齒最主要的病原菌，但不是唯一的，其他產酸菌也能參與齲齒的發生。冠部齲除變異鏈球菌外，乳酸桿菌也有一定作用；根部齲除變異鏈球菌外，黏性放線菌(Actinomyces visco-sus)最被重視。