確切的發病因素目前仍不清楚，可能與以下幾方面因素有關。
1.創傷因素 創傷被認為是EUOM的一個重要致病因素，EUOM患者多數有創傷因素存在，如銳利牙尖刺激、義齒戴入不當或有口腔黏膜咬傷或燙傷等明確外傷史。
2.免疫因素 EUOM病損區肥大細胞和嗜酸性細胞被認為在發病過程中發揮了一定作用。大量T細胞特異性的抗原遞呈細胞(包括朗格漢斯細胞和非朗格漢斯細胞)提示細胞介導的免疫反應可能參與EUOM的發生。還有人認為，多次創傷可引起組織抗原改變，或使微生物進入組織中，以上任何一種情況都能引發局部免疫反應。國內有報道EUOM患者ⅡgC、IgA降低，提示EUOM與免疫低下有關。用原位分子雜交和免疫組化技術發現在EUOM患者中，嗜酸細胞誘導的轉移生長因子(TGF-a和TGF-p)合成減少，提示可能削弱了正常組織的愈合機制。