可變剪接(alternative splicing)是指在同一個mRNA前體內部數個外顯子之間產生的差異性連接。這種剪接可以使同一個基因在不同的發育階段、不同分化狀態甚至不同生理狀態下,得到多個相似但有差異的mRNA,進而被翻譯為氨基酸序列相近似、性質和功能有差異的蛋白質。高度通用性的剪接位點GU-AG被同樣高度通用性的剪接體成對識別是剪接過程發生的先決條件。
可變剪接暗示了內含子的一種功能,即：由于內含子的存在,使可變剪接成為可能,其意義在于可使一個基因表達出多種蛋白質,擴大了DNA中遺傳信息的含量。