Holliday于1964年提m Holliday模型，將同源重組分為四個階段。
1．同源序列配對。
2．形成Holliday結構，即兩段同源序列的單股同源DNA的同一磷酸二酯鍵被水解，同源末端交換，連接，形成Holliday結構（HoIJiday structure，又稱Holliday連接體）。
3．形成異源雙鏈DNA，即Hollidav結構發生分支遷移，形成異源雙鏈DNA（hetero-duplex DNA。
4．Holliday結構解離，即兩段同源序列的單股同源DNA的同一磷酸二酯鍵被水解，Holliclay結構解離，連接切口，形成重組體。水解位點不同，所得到的重組體也就不同：
（1）兩次水解的是同股DNA，形成片段重組體（patch recombinant）。這種重組未發生實質性交換，依然是A-B、a-b。
（2）兩次水解的是異股DNA，形成拼接重組體（splice recombinant）。這種重組發生了實質性交換，產物是A-b、a-B。
大腸桿菌Holliday結構的解離由解離酶（resolvase） RuvC催化。RuvC是同二聚體，每個亞基含172AA。