病原學診斷標準如下：
①氣管內抽吸物培養。以消毒吸管經氣管導管吸取分泌物行細菌定量培養，如分離細菌濃度≥10 CFU/mL，則可診斷，敏感度為93%、特異度為80%。
②經氣管鏡保護性毛刷。刷取分泌物定量培養，以≥10 CFU/mL為診斷標準，是VAP最可靠的診斷方法。在未用抗生素時，其特異度為90%，但敏感度僅為40%～60%，這與其取材區域大小有關，如預先使用了抗生素，其敏感性則更低。
③經氣管鏡支氣管肺泡灌洗。本法可克服氣管鏡保護性毛刷取樣范圍小的缺點，以分離細菌≥10 CFU/mL為陽性，其敏感度和特異度為50%～90%，其陰性培養結果 對確認無菌肺組織的敏感度為63%、特異度為96%，故在排除VAP時有重要作用。
④陽性的膿液或血培養結果。多項研究證實，非支氣管鏡下氣管鏡氣管肺泡灌洗和氣管鏡保護性毛刷具有與氣管鏡同樣的效果，而且費用低廉、操作簡單。此4項中滿足任何一項即可 [7-8] 。