1.單純性腎囊腫
最常見的囊性腎病，系后天形成，隨年齡增加，發病率增加。
2.多囊腎
系腎臟出現無數囊腫的遺傳性腎病。按發病年齡分為成年型和嬰兒型。成年型為常染色體顯性遺傳，父母有一方患病，子女有50%可能發病；父母均患病，則子女發病率增加到75%。嬰兒型多囊腎是常染色體隱性遺傳，父母雙方均有致病基因才能使其子女發病，發病概率為25%。
3.腎髓質囊性病
與先天性發育異常或遺傳有關，癥狀和預后差異很大。
4.其他
囊腫性腎發育不良是兒童中最常見的腎囊性病變，單側最常見，也可為雙側，患腎失去正常形態和功能，常伴輸尿管梗阻。
終末期腎衰竭，長期血液透析或腹膜透析的患者易發生獲得性腎囊腫病。
其他較少見的包括：腎盂腎盞囊腫、腎淋巴血管瘤、腎門和腎周圍假囊腫等。