只要是編碼基因,則一定在體內發揮某一種功能,如果一群基因或蛋白是樣本變化后的主要結果,將基因或蛋白按照功能進行分類,可直觀看出樣本變化體現出的功能特點。但是,這些功能特點并不一定都是重要的,需要通過統計學分析,找到其中重要的功能。而后,還要對挑選的重要功能分類進行驗證,以保證分析的準確性。
對于多數物種來說,國際上最全面、最權威的基因功能分類方法是GO分類。大多數基因或蛋白都可以按照GO進行分類。通過統計分析,GO-Analysis可以定位出樣本變化中重要GO分類,其評價標準為Fiser精確檢驗后的顯著性水平P值<0.05,并通過多重比較檢驗,獲得FDR值,若GO的FDR<0.05,代表樣本變化是影響的最重要、且判斷最準確的GO。
此外,由于GO分類為層次分類,將層次較低、且P<0.05和FDR<0.05的GO突出定位的參數為Enrichment,該參數從大到小排列,將有助于篩選出對樣本影響非常具體、且有靶向性的功能。
一組研究人員繪制了有精神障礙以及無精神障礙的人腦中最大、最先進的基因調控網絡多維圖譜。這些圖譜詳細描述了協調大腦生物通路和細胞功能的許多調節元件。這項由美國國立衛生研究院(NIH)支持的研究使用了25......
來自中科院生物化學與細胞生物學研究所李勁松研究組和中國科學院神經科學研究所于翔研究組合作發表了最新成果:利用CRISPR/Cas9技術和細胞譜系示蹤技術對小鼠兩細胞胚胎中的單個卵裂球進行了基因敲除,一......
基因組編輯技術是最新發展起來的植物基因功能研究及定向育種的重要手段。在植物中實現基因組編輯的常規方法是將序列特異性核酸酶(如CRISPR/Cas9)的編碼DNA轉化植物細胞,穩定表達進而實現對目的基因......
“核心刊物”迎來了新期刊:科學通報,中國科學C輯:生命科學,這兩份期刊均是由中國科學院和國家自然科學基金委員會共同主辦的,我國學術期刊中的知名品牌,被國內外各主要檢索系統收錄,如國內的《中國科學論文與......
弗吉尼亞聯邦大學醫學院的研究人員最新發現,精子相關抗原6(SPAG6)有了某些新的功能,以前這種基因被認為只對纖毛的能動性有重要作用。該基因的缺陷與男性不育相關,盡管新的發現可能會對某些癌癥的診斷和治......
近日,中國科學院北京基因組研究所于軍研究員和雷紅星研究員合作開展的人類雙向成對基因功能網絡研究取得階段性進展,其研究論文FunctionalNetworkingofHumanDivergentlyPa......
近日,北京林業大學計算生物學中心研究人員將生物形狀幾何分析方法與基因功能作圖理論相結合,成功推導出一批影響生物形狀變異的基因定位新模型。該成果的兩篇論文日前發表于《生物信息學》和《遺傳學》。據專家介紹......
當一份開放獲取的期刊鼓勵注冊用戶對他們的撤稿發表評論時會發生什么?它得到了它所要求的東西。近期《PLoSONE》雜志發布通告撤回兩篇中國學者發布的論文,作者和讀者們對此發表了評論,質疑了編輯的撤稿決定......
來自中科院昆明動物所的研究人員發現在哺乳動物的一個重要轉錄抑制因子CDYL基因中,新外顯子反復在不同哺乳動物譜系中發生,而且這些新外顯子能給該基因帶來很大的功能改變,這說明基因中新外顯子的出現也是增加......
摘要基于高通量數據,研究人員已經設計了許多算法用于尋找功能完全未知蛋白質的功能.然而,這些算法的效率受到一些根本因素的制約,包括:(ⅰ)功能完全未知的蛋白質參與一個精細功能的先驗概率低;(ⅱ)高通量互......