由于加工、存放、運輸等過程可能使未填充的色譜柱沾污或損壞，所以，空的填充柱在使用之前一定要進行試漏和清洗。
試漏的方法：將柱管全部浸入水中，并將出口堵死，進口通以載氣，使載氣壓力稍高于正常操作壓力，填充柱應沒有氣泡冒出，否則，說明該填充柱漏氣，不能使用。
玻璃柱用洗液浸泡，洗滌兩次，然后用自來水洗沖到中性，再用蒸餾水、丙酮沖洗。潔凈的柱管內壁應不掛水珠，烘干后備用。不銹鋼柱先用10%鹽酸浸泡抽洗至抽洗液無金屬或其他懸浮物，用自來水沖洗至中性，再用10%熱堿液抽洗4～ 5次，以除去柱管內壁油膩性污物，用自來水沖洗至中性，最后用蒸餾水、丙酮沖洗，烘干備用。