復發性多發性軟骨炎應與感染性軟骨炎、前庭或耳蝸血管炎、喉和氣管的炎癥性疾病等相鑒別。出現反復發作的鞏膜炎或鞏膜外層炎葡萄膜炎時應與椎關節炎(病變)、類風濕關節炎、Sj?gren綜合征、Reiter綜合征類肉瘤病、結節性動脈炎Behcet病、幼年型慢性關節炎、Cogan綜合征、Wegner肉芽腫等所伴發的鞏膜炎、鞏膜外層炎或葡萄膜炎相鑒別。
復發性多發性軟骨炎應與系統性紅斑狼瘡、類風濕關節炎、Behcet病、Sj?gren綜合征、混合結締組織病等鑒別。