多基因遺傳的性狀為數量性狀（quantitative trait），它與單基因遺傳的性狀有所不同。單基因遺傳的性狀或疾病決定于一對等位基因，其變異在一個群體中的分布是不連續的，可以把變異的個體明顯地區分為2~3群，這2~3群之間差異顯著，具有質的不同，常表現為有或無的變異，所以稱這類性狀為質量性狀。
決定多基因速傳的基因也是按孟德爾遺傳規律分離和自由組合的，因此，多基因遺傳與單基因遺傳有共同的遺傳基礎。例如，有基因M即表現為先天性肌強直癥，無基崗好簡能合險性（mm）則為正常人，另外，在不完全顯性遺傳的情況下，可看到三種變異性狀，但也是不連續的。例如，正常人的苯丙氨酸羥化酶活性為100%，攜帶者的酶活性為正常人的45%~50%，苯丙酮尿癥患者的酶活性僅為正常人的5%，這分別決定于基因型AM、Aa和aa。