引起多系統器官功能衰竭的主要原因有：
1.重癥感染
有70%～80%的多系統器官功能衰竭是在重癥感染的基礎上發生的。
2.休克
①長時間組織灌流不足，引起低氧血癥和細胞損害；②毒性因子或體液因子直接影響組織細胞；③休克治療時某些藥物的副作用，均可引起多系統器官功能衰竭。
3.非感染性的嚴重病變
如急性胰腺炎、廣泛性組織損傷等。尤其是當機體的免疫功能和單核吞噬細胞系統功能減弱時，或者是治療不當或延誤時，如未及時糾正組織低灌流和酸堿平衡紊亂、過多過快輸液、大量輸血或過量應用鎮靜劑、麻醉劑等情況下，更易引起多系統器官功能衰竭。