⑴N端甲酰蛋氨酸或蛋氨酸的切除：N端甲酰蛋氨酸是多肽鏈合成的起始氨基酸,必須在多肽鏈折迭成一定的空間結構之前被切除。
其過程是：
① 去甲酰化；
② 去蛋氨酰基。
⑵氨基酸的修飾：由專一性的酶催化進行修飾,包括糖基化、羥基化、磷酸化、甲酰化等。
⑶二硫鍵的形成：由專一性的氧化酶催化,將-SH氧化為-S-S-。
⑷肽段的切除：由專一性的蛋白酶催化,將部分肽段切除。
