女性生殖器結核，當結核桿菌感染到一易感宿主后，局部組織首先出現多形核白細胞的炎性滲出，48小時內即被單核細胞所代替，并變成結核桿菌在細胞內繁殖復制的最初場所。當細胞免疫出現后，結核桿菌被消滅，組織發生干酪性壞死。以后如感染灶重新激活，乃引起增生性肉芽腫病損—結核結節。典型的組織圖像：中央是干酪性壞死組織，四周圍以同心層的類上皮細胞及多核巨細胞，其外周為淋巴細胞，單核細胞及成纖維細胞浸潤。
女性生殖器官結核中輸卵管是受累最多的部位，占90～100%，多為雙側性。子宮受累為50～60%，幾乎全部在子宮內膜，很少侵入肌層。卵巢結核常從感染的輸卵管直接蔓延而來，由于卵巢周圍有一層堅韌的白膜，感染率低于子宮內膜，占20～30%，至少有一半為雙側性。宮頸結核來源于子宮內膜結核的下行感染，如作連續宮頸切片并不罕見，可占5～15%。陰道、外陰結核偶見，約占1%。