本病為甲狀腺非化膿性感染性疾病，又稱De Quervain病，病因至今未完全闡明，為非特異性。目前認為本病可能與病毒感染有關，常發生于病毒感染后2～3周，如腮腺炎病毒。亞急性甲狀腺炎常在流行性腮腺炎流行期間發病高。曾從2例病人甲狀腺組織分離出腮腺炎病毒，11例中有10例病人體內抗腮腺炎病毒抗體滴度陽性，故可能系病毒感染后免疫反應性疾病，兒科有報道繼本病之后發展為甲低。HLA-BW35基因型曾報告與患亞急性甲狀腺炎有關。還有埃柯病毒，柯薩奇病毒等。也有人報道甲狀腺外傷和放射性損害也可導致本病，為無痛性變異型，可以急性、亞急性，偶爾慢性過程。