1.多數腦脊液無明顯異常
少數病兒在急性期出現腦脊液的輕微異常，如蛋白和細胞輕度增高（白細胞20～60）或免疫球蛋白增高。病原直接感染腦組織的病例腦脊液可能有明顯的炎性反應，可找到病原或相應的抗體。聚合酶鏈式反應（PCR）技術可幫助發現特異病原腦脊液寡克隆IgG常為陰性。近年發現在水痘后小腦性共濟失調的病例有小腦的脫髓鞘病變。
2.腦電圖檢查
多為正常，腦電圖急性期可能出現慢波增多等非特異性改變。
3.MRI檢查
可排除腦占位病變。
