40%的病例并發于敗血癥或軟組織化膿感染。致病菌常為溶血性金黃色葡萄球菌，近年來也有毒性較強的溶血性白色葡萄球菌，偶爾可見沙門桿菌、肺炎球菌或其他化膿菌，大部分對青、鏈霉素有抗藥性。常見的原發病灶有膿皰、齒齦膿腫及上呼吸道感染。
1.間接因素
臨床上，扭傷和挫傷等所致局部組織損傷，常為骨髓炎發生的間接原因。
2.機體因素
小兒長管狀骨的干骺端和骨骺間的血運不直接相通，干骺端營養動脈的分支近端折回呈小襻狀，再注入竇內較大靜脈，該處血流速度減慢，成為致病菌滯留繁殖的理想條件，是小兒骨髓炎較成人多見的病理生理方面的原因。