小葉性肺炎多由細菌感染所致，常為多種細菌混合感染。凡能引起支氣管炎的細菌幾乎都能導致本病。常見的致病菌通常為口腔及上呼吸道內致病力較弱的常駐寄生菌，如肺炎鏈球菌、葡萄球菌、綠膿桿菌、大腸桿菌、流感嗜血桿菌等。某些誘因如患急性傳染病、營養不良、受寒等使機體抵抗力下降，呼吸道的防御機能受損，粘液分泌增多，這些細菌即可入侵細支氣管及末梢肺組織并繁殖，引起小葉性肺炎。病原菌多經呼吸道侵入肺組織，僅少數經血道引起本病。某些因大手術、心力衰竭等長期臥床的病人，由于肺部血液循環緩慢，產生肺淤血、水腫，加之血液本身的重力作用，使侵入的致病菌易于繁殖，導致墜積性肺炎（hypostatic pneumonia）。全身麻*醉、昏迷病人及某些溺水者或胎兒由于某些原因發生宮內呼吸等，常誤將分泌物、嘔吐物等吸入肺內，引起吸入性肺炎（aspiration pneumonia）。這兩種肺炎亦屬于小葉性肺炎。