小腸炎性疾病是一組病變，其病因和發病機制也不同。克羅恩病的病因不明，可能與感染、遺傳、體液免疫、細胞免疫有一定關系。急性出血性腸炎同樣病因不明，可能與腸道缺血感染有關。腸結核是結核分枝桿菌引起的腸道慢性特異性感染。腸傷寒穿孔是由傷寒桿菌引起。抗生素相關性腸炎多在應用抗生素之后導致腸道菌群失調引起。腸憩室炎是因為憩室內長期殘存的食物殘渣反復刺激引起。放射性小腸炎是惡性腫瘤放射治療后的并發癥。
