1、胃鏡采樣檢測
檢測是否有幽門螺桿菌。如果為陽性，即可確診幽門螺桿菌感染陽性。
2、細菌的直接檢查
通過胃鏡檢查鉗取胃黏膜（多為胃竇黏膜）作直接涂片、染色，組織切片染色及細菌培養來檢測Hp。其中胃黏膜細菌培養是診斷Hp最可靠的方法，可作為驗證其他診斷性試驗的“金標準”，同時又能進行藥敏試驗，指導臨床選用藥物。
3、尿素酶檢查
可通過檢測尿素酶來診斷Hp感染。尿素酶分解胃內尿素生成氨和二氧化碳，使尿素濃度降低、氨濃度升高。基于此原理已發展了多種檢測方法：①胃活檢組織尿素酶試驗；②呼吸試驗；③胃液尿素或尿素氮測定；④15N-尿素試驗。
4、免疫學檢測
通過測定血清中的Hp抗體來檢測Hp感染，包括補體結合試驗、凝集試驗、被動血凝測定、免疫印跡技術和酶聯合吸附測定（ELISA）等。
5、聚合酶鏈反應技術
慢性胃炎患者Hp的檢出率很高，50%～80%，慢性活動性胃炎患者Hp檢出率則更高，達90%以上。