1.胃鏡檢查
胃鏡可見幽門隔膜存在，診斷較準確。
2.X線檢查
X線鋇餐檢查無孔幽門隔膜者可顯示胃部明顯擴張，幽門呈圓弧狀，腸腔內無氣體；有孔幽門隔膜者可顯示中央裂孔處鋇劑通過延遲，但與先天性肥厚性幽門狹窄不易鑒別。
3.B超檢查
B超檢查可輔助鑒別診斷是否為膽囊或肝臟疾病。
4.其他
血常規可鑒別是否感染性疾病；有脫水癥狀者，電解質檢查可了解有無水電解質紊亂。
