慢-快綜合征可由多種疾病導致，如冠狀動脈粥樣硬化性心臟病（冠心病）、原發性高血壓、甲狀腺功能亢進、心肌炎、心肌病等，也可原因不明。各種病因使竇房結內原有起搏細胞功能暫時性或永久性喪失，使竇房結附近的心房肌甚至遠離竇房結部位的心肌組織自律性得以表現，從而出現與竇性心動過緩相關聯的一系列心律失常，包括陣發性室上性心動過速、房性心動過速、心房撲動或心房顫動等。亦可能是由于其他陣發性心動過速治療過程中由于心臟抑制藥物長期或聯合用藥，以及其他治療方法所致的心動過速終止后形成的嚴重心動過緩，甚至停搏。各種原因所致緩慢性心律失常合并室性快速性心律失常。頸動脈竇綜合征及長Q-T間期綜合征患者也可出現。