本征應主要與心動過速-心動過緩綜合征相鑒別。
1.心動過緩-心動過速綜合征平時有持續竇性心動過緩或竇性停搏或竇房傳導阻滯的證據,并伴各種快速性房性心律失常,即快速性心律失常發生在緩慢性心律失常的基礎上,且其心電圖有明顯病態竇房結綜合征表現,竇房結功能異常。
2.心動過速-心動過緩綜合征平時無心動過緩,發生在正常竇性心律基礎上,僅在快速心律失常終止時因一過性竇房結功能受抑制而導致竇性停搏的發生,其心電圖無病態竇房結綜合征表現,竇房結功能正常。