急性感染性心內膜炎常因化膿性細菌侵入心內膜引起，多由毒力較強的病原體感染所致。由于廣譜抗生素的普遍使用，致病菌種發生改變，許多致病微生物均可引起急性感染性心內膜炎。如金黃色葡萄球菌、鏈球菌，包括不同類型的變異體。其中葡萄球菌感染為醫源性和靜脈內藥物濫用者的感染性心內膜炎的最主要原因。心臟起搏器感染多為表皮葡萄球菌和金黃色葡萄球菌感染。真菌多見于心臟手術和靜脈注射麻醉藥物成癮者中。
