慢性病毒性肝炎目前尚缺乏特效的治療方法。任何藥物都不曾顯示其對慢性病毒性肝炎的明確而肯定的療效，因此目前仍在進行各種試驗治療。鑒于本病的發病原理可能與病毒株的毒力，受感染細胞的數量和患者免疫系統的效應等因素有一定關系，其治療藥物大體分三類：
①抗病毒藥物：包括人白細胞干擾素、人體纖維細胞干擾素、人免疫干擾素、阿糖胞苷、磷酸阿糖胞、無環鳥苷、病毒唑、磷羧基甲酸、聚肌胞苷。其中以干擾素療效較為肯定。
②免疫調節劑：乙肝免疫球蛋白、左旋咪唑、乙肝疫苗、轉移因子、免疫核糖核酸、卡介苗、免疫抑制劑、胸腺肽、豬苓多糖等，其中以免疫核糖核酸較為有效。
③改善肝細胞功能 藥物：如肌苷、復合維生素B、維生素C、維生素K、促肝細胞生長素等。