1、實驗室檢查
診斷消化系統疾病常用的實驗室檢查包括血尿便常規、血尿淀粉酶、肝腎功能、血糖、酮體。血白細胞增高見于炎癥，嗜酸粒細胞增多見于過敏、寄生蟲感染及嘈酸粒細胞增多癥；糞便隱血提示上消化道疾病并出血，排血便多見于下消化道出血；血尿淀粉酶成倍增高有助于急性胰腺炎的診斷。
2、X線檢查
胸腹部平片可了解膈肌運動情況，明確有無膈下游離氣體，腸積氣、液平面。X線鋇劑及鋇劑灌腸造影有助于了解上下消化道情況。但如懷疑有胃腸穿孔、腸梗阻或2周內有大量出血者不宜行此檢查。
3、B超檢查
可顯示肝、膽、胰、脾、腎這些實質器官及腹腔病變，對診斷肝癌、肝膿腫、膽道結石等有較大價值。彩色多普勒超聲有助于腹腔臟器血管病變的診斷。[3]
4、內鏡檢查
消化道內鏡檢查可直接觀察各種病變，取活組織進行病理學檢查，并對某些良、惡性病變可行鏡下治療。對一些腹痛原因難以明確者宜行腹腔鏡檢查。
5、CT、MRI、MRCP檢查
計算機X線斷層照相術(CT)和磁共振(MRI)對病灶的定位、定性效果較好，因此對腹腔實質臟器病變的診斷具有重要價值。磁共振膽胰管成像(MRCP)耐膽胰系統病變的診斷率高，而且具有無創傷性的優點。
6、診斷性腹腔穿刺和剖腹探查
腹穿對腹膜炎和內臟破裂具有診斷價值。B超導向下對腹腔實質性占位病變進行細針穿刺做病理檢查有助于定性診斷。對于高度懷疑腹腔內臟的病變而其他檢查又不能確診者，可考慮剖腹探查。