在診斷成骨源性肉瘤時,應排除其他腫瘤,如骨母細胞瘤、軟成骨源性肉瘤、纖維肉瘤,以及轉移性骨腫瘤等。骨干上的成骨源性肉瘤有時會與Ewing肉瘤混淆。其他如Brodie膿腫、骨髓炎、骨結核,甚至骨痂,有時也會被誤診為成骨源性肉瘤。術前結合臨床表現與影像檢查和穿刺活檢是必要的鑒別診斷手段。