扁桃體紅腫的診斷可目視扁桃體的狀況。讓患兒張大嘴巴,觀察扁桃體及口咽的變化則可以知道是否有扁桃體炎。不過醫生除了要診斷是不是扁桃體炎之外,另一個重要工作是要區分到底是細菌性感染還是病毒性感染,有沒有全身性感染,會不會有其他并發癥。通常細菌性疾病可能需要使用抗生素治療,而病毒性疾病則不需要抗生素,有需要的話可以抽血檢查來幫助診斷。