抗真菌免疫—至今還了解不多。在已知的非特異性免疫中，皮膚分泌的脂肪酸有抗念珠菌的作用，陰道分泌的酸性分泌物也有抑制念珠菌的能力。長期應用廣譜抗生素可造成菌群失調，導致真菌感染。
在真菌感染中雖然出現體液抗體，但有關它的防御作用現在還沒有定論，只是以抗體的存在作為感染的反映而矣。在缺乏T細胞的患者中，真菌感染的發病率增高，這表明細胞免疫起主要作用。在播散性真菌感染中，常會發現T細胞功能低下，但目前還不清楚這種現象究竟是原因還是結果。真菌感染大多是慢性感染，常伴隨著超敏反應（Ⅳ型變態反應），因此，可用真菌提取物即真菌素（毛癬菌素、念珠菌素等）作皮膚試驗。這種試驗既可反映是否感染，也可顯示機體的細胞免疫狀態，因而成為檢測機體細胞免疫的常用方法之一。