新生兒低凝血原癥分為先天性和后天性兩種。人體正常凝血需要凝血酶原的參與，如果缺乏，容易出現難以控制的出血。凝血酶原生成時需要維生素K參與，維生素K缺乏導致凝血酶原生成缺乏或異常。
1.先天性低凝血酶原血癥
主要見于相關凝血因子的缺乏。主要是維生素K缺乏。遺傳性凝血酶原缺乏癥是一種罕見的凝血因子遺傳性缺陷，因功能正常的蛋白質合成降低所引起者又稱低凝血酶原血癥，而異常蛋白質分子合成引起者稱為異常凝血酶原血癥。前者交叉反應物質陰性，后者則陽性。目前認為異常凝血酶原血癥的病例多于低凝血酶原血癥。
2.后天性低凝血酶原血癥
主要見于嚴重肝病、維生素K缺乏等。維生素K缺乏的原因有：
（1）胎盤屏障作用 由于孕母體內維生素K不易通過胎盤，故血中維生素K水平和肝內儲存都較低。
（2）母體供給不足 由于母乳中維生素K含量很少，遠低于配方奶喂養兒，因此，母乳喂養兒容易發生維生素K缺乏。
（3）自身生成不夠 維生素K的合成需要腸道細菌的參與，新生兒剛出生時腸道細菌很少，因此，容易發生維生素K缺乏。