1、低鎂血癥—先天性酶儲備不足
胎兒從母親獲得鎂主要在孕期后3個月，早產兒、多胎或母親低血鎂癥都可導致胎兒鎂儲備不足。宮內發育遲緩：胎盤轉運鎂障礙，胎兒攝取鎂減少。
2、低鎂血癥—鎂攝入減少
新生兒患有肝病或腸道手術后吸收不良。單純牛乳喂養時因磷攝入多影響鎂的吸收。腹瀉時影響腸道對鎂的吸收。
3、低鎂血癥—鎂丟失增加
腎小管疾病：缺氧缺血先天異常等可使腎小管重吸收鎂減少。有些藥物可抑制腎小管對鎂的重吸收，使尿鎂排泄增加，如利尿藥氨基糖苷類抗生素等。糖尿病母親因腎重吸收鎂發生障礙，常有缺鎂和甲狀旁腺功能低下，導致新生兒低鎂血癥。