1、新生兒原發性肺不張的肺功能檢查：可見肺容量減少，肺順應性下降，通氣/血流比率異常以及程度輕重不等的動靜脈分流，低氧血癥等。
2、新生兒原發性肺不張的X線檢查：X線特點為均勻致密陰影，占據一側胸部，一葉或肺段，陰影無結構，肺紋理消失及肺葉體積縮小，一側或大片肺不張時可見肋間變窄，胸腔縮小，陰影位置隨各肺葉肺不張的部位而異，可出現代償性肺氣腫、氣管與心臟移位及膈肌上升等。由于表面活性物質不足造成的微型肺不張，肺多呈毛玻璃狀陰影，X線表現與小葉肺炎無異。
3、新生兒原發性肺不張的肺部CT或支氣管鏡檢查：必要時可進行肺部CT或支氣管鏡檢查以確定病變部位及性質。