由于新生兒肺小動脈肌層在出生前即已過度發育，因某些病因所致低氧血癥和酸中毒時，可致肺小動脈痙攣，造成生后肺動脈壓力增高和肺血管阻力持續存在。宮內或出生后缺氧酸中毒有關的病因有以下幾種：
1.宮內因素
如子宮-胎盤功能不全導致慢性缺氧，橫膈疝、無腦兒、過期產、羊水過少綜合征等。又如母親在妊娠期服用阿司匹林或吲哚美辛等。
2.產時因素
出生時嚴重窒息及吸入（尤其是吸入被胎糞污染的羊水等）綜合征等。
3.出生后后因素
先天性肺部疾患，肺發育不良、包括肺實質及肺血管發育不良、呼吸窘迫綜合征(RDS)；心功能不全等。病因包括圍生期窒息、代謝紊亂、宮內動脈導管關閉等；肺炎或敗血癥時由于細菌或病毒、內毒素等引起的心臟收縮功能抑制，肺微血管血栓，血液黏滯度增高，肺血管痙攣等；中樞神經系統疾患、新生兒硬腫癥等。此外，許多化學物質影響血管擴張和收縮，因而與胎兒持續循環有關。總之，除了少數原發性肺小動脈肌層過度發育及失松弛外其他任何嚴重缺氧和酸中毒均可導致肺動脈壓力上升甚至導致動脈導管及卵圓孔的右向左分流。