一組高度酸性的核糖體蛋白（RP），也稱為P蛋白，在核糖體莖中以多拷貝存在于60S亞基上，P蛋白介導選擇性翻譯[30]。這些P蛋白可以在酵母和哺乳動物細胞中找到。如果酵母中沒有P蛋白，酵母對冷敏感。如果人體細胞缺失P蛋白，誘導細胞自噬。
某些核糖體蛋白是絕對關鍵的，而其它核蛋白則不是。例如，在小鼠中，Rpl38是Hox mRNA亞組翻譯所必需的，而Rpl38的突變導致短尾的同源異型轉化。
對核心核糖體蛋白（RP）的修飾也可以引起異質核糖體的形成。
