人流感病毒：分甲、乙、丙 3型。甲型流感病毒血凝素和神經氨酸酶的抗原性易發生變異，小變異時出現變種，引起不同程度的流行；大變異時出現新亞型，可造成世界性大流行。乙型流感病毒僅有小變異，造成較小流行。丙型主要侵犯嬰幼兒。有些人甲型流感病毒還能感染哺乳類和禽類。甲、乙型流感病毒能人工感染雪貂并于連續傳代后適應于小鼠。通常采用雞胚或猴腎細胞分離和培養。
豬流感病毒：甲型流感病毒的 1種，1930年首次從豬分離到，后被認為可能是1918年世界性流感大流行的病原。豬流感的癥狀與人流感相似。過去僅在北美豬群中流行，現已波及許多國家。偶爾可由豬傳染人。
真性雞瘟病毒：1900年發現，1955年才被確認為甲型流感病毒的 1個亞型。在雞群中造成嚴重的全身性疾病，病死率常達100%。近年已少見。中國無此病。
狗流感病毒：已知H3N8攻擊人體呼吸道內的一種蛋白質SAα-2,6,這是種receptor（受體蛋白）是和HIV攻擊的CD4蛋白質一樣的
其他動物流感病毒：在動物（特別是禽類）中發現了甲型流感病毒的許多亞型，如馬流感病毒有兩個亞型，能在馬群中引起流感狀疾病；火雞流感病毒的幾個亞型能引起類似真性雞瘟的疾病。此外，從野生水鳥和家鴨中分離到許多亞型，這些病毒能在腸道中繁殖，一般不引起明顯的疾病。中國曾從豬中分離到丙型流感病毒。