1、急性毒性
氟伐他汀在小鼠的LD50大于2 g/kg，在大鼠的LD50大于0.7 g/kg。
2、重復劑量毒性
在大鼠、兔子、狗、猴子、小鼠以及倉鼠中進行了深入的毒性研究，評價氟伐他汀的安全性。研究結果與HMG-CoA還原酶抑制劑的結果相同，例如嚙齒類動物非腺型胃部的細胞增生和過度角化，狗出現白內障，嚙齒類動物出現肌病，大多數試驗動物的肝臟出現輕微的變化，狗、倉鼠和猴子的膽囊出現變化，大鼠甲狀腺重量增加，倉鼠睪丸出現病變。尚無試驗數據表明，氟伐他汀和其它此類藥物對狗CNS血管及變性方面有所影響。
3、致癌性
以每天6、9、18 mg/kg的給藥劑量（一年后將劑量增加到每天24 mg/kg）進行的一項大鼠致癌性研究，以獲得最大耐受劑量。在這樣的給藥劑量下，相當于人治療劑量（口服給藥40 mg）下血藥濃度的9、13和26-35倍。在每天24 mg/kg的劑量水平下，出現胃前鱗狀細胞乳頭狀瘤和胃前癌的機率非常低。此外，對于每天按18-24 mg/kg給藥的雄性大鼠，甲狀腺濾泡細胞瘤以及甲狀腺濾泡細胞癌的發病率有所升高。
以每天0.3、15、30 mg/kg的給藥劑量進行小鼠致癌性研究，與大鼠致癌性研究一樣，在每天30 mg/kg劑量下的雄性和雌性小鼠以及在每天15 mg/kg的雌性小鼠，其胃前鱗狀細胞乳頭狀瘤的機率明顯增加。在這樣的給藥劑量下，相當于人治療劑量（口服給藥40 mg）下血藥濃度的0.2、10和21倍。
大鼠和小鼠出現胃前腫瘤是由于動物的胃部長期與氟伐他汀直接接觸而導致細胞增生，而不是藥物具有致癌作用。給予氟伐他汀后，大鼠甲狀腺濾泡細胞瘤發生率有所增加，這與其他HMG-CoA還原酶抑制劑的試驗結果相同。與其他HMG-CoA還原酶抑制劑不同的是，氟伐他汀鈉并未導致肝臟腫瘤發生率增加。
4、致突變性
通過體外試驗發現，無論是否存在大鼠肝臟代謝活性，氟伐他汀均沒有出現致突變性。主要試驗包括：采用鼠傷寒沙門氏菌或大腸桿菌的突變菌株進行的微生物突變試驗；BALB/3T3的惡性變異分析；大鼠肝細胞的異常DNA合成；V79中國倉鼠細胞染色體異常；HGPRT V79中國倉鼠細胞等。并且，氟伐他汀在大鼠或小鼠體外試驗中沒有出現致突變性。
5、生殖毒性
在一項生殖毒性動物試驗中，雌性大鼠的給藥劑量分別為每天0.6、2、6 mg/kg，雄性大鼠的給藥劑量分別是2、10、20 mg/kg，氟伐他汀沒有出現任何生殖毒性。在一項對大鼠（1、12以及36 mg/kg）和兔子（0.05、1以及10 mg/kg）進行的致畸試驗中，結果顯示氟伐他汀在高劑量下具有母代毒性，但并不具有胚胎毒性和致畸作用。在一項對雌性大鼠進行的試驗中，在大鼠懷孕后期到斷奶分別按每天12和24 mg/kg的劑量給予氟伐他汀，結果導致在產前和產后的母體死亡，并伴有子代死亡。在每天2 mg/kg低劑量給藥下，對母代和子代均沒有影響。
另一項試驗是在懷孕晚期和哺乳期早期的給藥劑量分別為每天2、6、12以及24 mg/kg，試驗結果與前一個試驗相似。在第三項試驗中，在懷孕晚期至斷乳期間，分別在同時給予3-甲基-3，5-二羥戊酸或不給予3-甲基-3，5-二羥戊酸的條件下按每天12和24 mg/kg劑量給予氟伐他汀，3-甲基-3，5-二羥戊酸為HMG-CoA的衍生物，對于膽固醇的生物合成有重要的影響。同時給予3-甲基-3，5-二羥戊酸完全可預防心臟毒性和子代及母代的死亡率。因此，母代和子代的死亡是氟伐他汀在孕期內藥理作用增強的結果。