不良反應較輕，大劑量時耐受性較好。①常見不良反應有失眠、惡心、易激動、頭痛、運動性焦慮、精神緊張、震顫等，多發生于用藥初期。有時出現皮疹（3%）。②大劑量用藥（每日40～80mg）時，可出現精神癥狀，約1%患者發生狂躁或輕躁癥。長期用藥常發生食欲減退或性功能下降。
本品最多見的副作用為惡心，發生率是23％，但比較輕，經常伴有嘔吐，隨服藥時間延長而自行緩解。有3％在治療初期發生皮疹，多在一周內自行消失；也有相當嚴重的，一旦發生應立即停藥以防意外。一些回顧性研究認為，本品沒有誘發癲癇、流感樣反應等潛在危險；其轉躁狂發生率不高于maoi類藥。老年人服用氟西汀毋須減量，但若肝